Im Mai 2006 entstand eine erste Kooperation zwischen der Fraunhofer-Gesellschaft und der Leibniz-Gemeinschaft.

Im Oktober 2008 unterzeichneten die Fraunhofer-Gesellschaft, die Leibniz-Gemeinschaft und die Stiftung Preußischer Kulturbesitz während eines Festaktes im Alten Museum in Berlin ein gemeinsames Memorandum of Understanding.

Der Forschungsallianz Kulturerbe schlossen sich acht Institute der Fraunhofer-Gesellschaft, acht Forschungsmuseen der Leibniz- Gemeinschaft und fünf Haupteinrichtungen der Stiftung Preußischer Kulturbesitz an.

Im Juli 2014 wurden die Staatlichen Kunstsammlungen Dresden und die Sächsische Landesbibliothek – Staats- und Universitätsbibliothek Dresden als assoziierte Partner in die Forschungsallianz Kulturerbe aufgenommen.

Heute sind wir eine Allianz aus 23 Fraunhofer-Instituten und -Einrichtungen, acht Leibniz-Forschungsmuseen, fünf Einrichtungen der Stiftung Preußischer Kulturbesitz, den Staatlichen Kunstsammlungen Dresden und der Sächsischen Landesbibliothek – Staats- und Universitätsbibliothek Dresden.